A EAP foi criada em março de 1985, na gestão do presidente Antônio José da Silva Nogueira, quando a sede da ABO-PA ainda funcionava no Edifício Antônio Velho. A primeira Diretoria da EAP foi composta pelos cirurgiões-dentistas Antônio José da Silva Nogueira (coordenador), Maria do Carmo Caixeta, Ângela Santos Costa e Arcelino Lobato Neto.
Os primeiros cursos implantados foram Endodontia, Odontopediatria e Radiologia, tendo como coordenadores os professores Edyr de Brito Alves, Antônio José da Silva Nogueira e Paulo Sérgio Barros respectivamente.
Em 17 de maio de 1985, esses cursos foram credenciados pelo Conselho Federal de Odontologia (CFO), por meio da Portaria nº 06/85.
Apesar das dificuldades enfrentadas no início, a EAP cresceu muito e hoje oferece nove Cursos de Especialização.
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